Das Kloster Zayiin Gegeen befindet sich in Tsetserleg, Archangai, am Fuße des Bulgan-Berges und wurde Mitte 1600 erbaut. Das Kloster wurde Zayiin Gegeen gewidmet, und es wurde zwischen ihm, Lamyn Gegeen und Shireet Gegeen beschlossen. Sie waren auf der Suche nach einem Ort, insbesondere dem Fuß eines Berges, um ein Kloster zu bauen, und fanden den Bulgan-Berg. Sie verbrachten dort eine Nacht und beschlossen, dass derjenige, in dessen Schale zuerst eine Blume wächst, ein Kloster in seinem Namen bauen darf. Am nächsten Morgen erschien eine Blume in der Schale von Zayiin Gegeen.
Und im Jahr 1696 machte der zweite Zayiin Gegeen Luvsanperenlei den Guden-Tempel zu seiner Residenz, der der erste Tempel des Klosters ist. Der andere große Tempel ist der Semchin-Tempel und wurde 1802 erbaut. Er wurde im Auftrag des dritten Zayiin Gegeen Luvsanjigmeddorj erbaut und auch er residierte in diesem Tempel.
Das Zayiin-Gegeen-Kloster bestand früher aus zwei Klöstern, die 5 km voneinander entfernt waren, und hatte 26 Tempel. Es war eines der größten und einflussreichsten Klöster der Mongolei, in dem über 1000 Mönche lebten.
Die Leichen von II, III, IV Zayiin Gegeen und V Bogd wurden in den Tempeln des Klosters Zayiin Gegeen aufbewahrt, aber von der kommunistischen Armee herausgeworfen und unter der Erde vergraben. Der Körper des ersten Zay Bandid oder des zweiten Zayiin Gegeen wurde jedoch später wiedergefunden.
Das Kloster wurde 1997 als Museum wiedereröffnet.
